地理科学学部心理健康教育中心是地理科学学部直属的学生组织，受学部分团委的监督和管理。面向地理科学学部全体本科生和研究生，开展团队辅导、专题讲座、心理咨询、心理测试、心理课堂等各种形式的特色心理健康教育活动，使更多的学生获得心理健康的知识，自觉维护自身和他人心理健康，提升学生的心理健康素质。中心具有强大的基础设施：三家环境优雅、舒适温暖、休闲娱乐的生活指导室小屋，分别为赏图苑、品茗轩、望月阁。中心下设“贴心、细心、用心”的10名助管，分属于团队辅导项目、深度辅导项目、雪绒花督导项目和专题活动项目组。